科技重大专项资金是专项用于支持呼市科技重大项目研发及其产业发展的资金，较好地解决制约经济社会发展的科技难题、支持和推动企业提高自主创新能力的项目资金。根据《关于对呼和浩特市本级行政事业单位2018年部门预算指标的批复》和《呼和浩特市科技局关于2018年呼和浩特市重大科技专项资金安排的请示》文件精神及市政府的批示精神，呼市财政局近期下达了2018年市本级科技重大专项资金3000万元，扶持了呼市市本级及9个旗县区的43家企业45个项目，截止目前，呼市共拨付2018年重大科技资金6900万元，其中自治区重大科技资金3900万元，市本级科技重大资金3000万元，此项资金的下达对于推动和提高呼市科技企业自主创新能力起到了积极的促进作用。